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SIME-NGANDO Télesphore


Contact :

Télesphore SIME-NGANDO

Directeur

Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement

UMR CNRS 6023

Bât. Biologie A, 24 avenue des Landais, BP 80026

63171 Aubière Cedex. France.

Tél : 33 (0)4 73 40 78 36

Fax : 33 (0)4 73 40 76 70

Telesphore.SIME-NGANDO@univ-bpclermont.fr


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T Sime Ngando Resume (English)

Equipe de recherche

- Virus et Métabolismes microbiens en milieu aquatique

Recherches actuelles

L’ensemble de mes recherches se situe dans le domaine de la microbiologie environnementale, avec pour principaux mots clés : limnologie, océanographie biologique, écologie microbienne aquatique, écologie virale aquatique, boucle microbienne, réseaux trophiques microbiens, microorganismes hétérotrophes, protistes, eumycètes, bactéries, archées, virus, espèces rares.

Le monde microbien, au sens large du terme, comprend les trois grands domaines cellulaires du vivant (Archea, Bacteria, Eukarya) et le domaine proposé (Akamara) des agents biologiques acellulaires (virus, plasmides, agents transducteurs généralisés, prions,…). Grâce à des avancées technologiques récentes, notamment celles liées aux approches dites ‘omiques’, on réalise aujourd’hui l’étendue de leur diversité et de la complexité des métabolismes mis en jeu. En conjonction avec des temps de génération très courts, un faible rapport surface sur volume, une capacité de mutations génétiques élevée, l’absence de contraintes sexuelles et leur antiquité, les microorganismes sont des acteurs essentiels dans les cycles biogéochimiques qui sous-tendent le fonctionnement de la biosphère. Ils sont omniprésents dans tous les écosystèmes (eau, sol, air), y compris ceux présentant les conditions abiotiques les plus extrêmes. Leur diversité génétique et fonctionnelle est à la base des processus qui régissent le fonctionnement, l’organisation biologique, la dynamique et la pérennité de notre environnement. C’est dans ce cadre scientifique que se situent mes préoccupations de recherche en cours, centrées sur l’importance des virus/phages et autres parasites (eumycètes) dans la structure et le fonctionnement des écosystèmes aquatiques.

Entités biologiques de taille comprise entre macromolécules et cellules vivantes, les virus sont des parasites cellulaires obligatoires. Malgré les difficultés liées à l’observation de particules nanométriques et à l’absence de traceurs évolutifs comme l’ARN ribosomal, on considère que les virus représentent un des plus grands réservoirs de la diversité génétique non caractérisée de notre planète. Omniprésents dans les écosystèmes aquatiques, certains contiennent des gènes codant pour des fonctions biologiques, dont la circulation fait des populations hôtes de puissants vecteurs d’échanges génétiques dans l’environnement. Les phages sont très abondants dans les écosystèmes aquatiques, généralement plus abondants que les procaryotes dont l’activité conditionne leur prolifération. D’un point de vue fonctionnel, le rôle des virus est essentiel dans divers processus structurant la dynamique de la biodiversité microbienne aquatique : mortalité cellulaire, cycles biogéochimiques, transferts horizontaux de gènes. Ainsi, l’écologie virale suscite elle, aujourd’hui, un intérêt croissant dans le cadre général des sciences de l’environnement, mais aussi de l’évolution adaptative de la vie cellulaire, support obligatoire de la prolifération virale.

Quant aux autres parasites, leur importance dans le fonctionnement des écosystèmes microbiens est, aujourd’hui, tout simplement ignorée. Des études moléculaires récentes nous ont permis de mettre en évidence l’importance des parasites eucaryotes, notamment des Chytrides, dans le plancton lacustre. Cette découverte, en conjonction avec les différentes stratégies trophiques des eumycètes (saprotrophie, parasitisme) et de leur potentiel comme sources d’éléments nutritifs essentiels à la croissance des prédateurs, pose aujourd’hui la question du rôle des eumycètes dans le fonctionnement des écosystèmes aquatiques et des cycles biogéochimiques associés. Il est donc important (i) de préciser la diversité des eumycètes (nous le faisons par par affiliation génétique du gène codant pour l’ARNr 18S, par la métagénomique et par microscopie), (ii) d’élaborer des outils, notamment moléculaires, permettant une étude quantitative fiable des différents stades de vie, et (iii) de déterminer le rôle fonctionnel de ces microorganismes, notamment comme agents régulateurs du développement phytoplanctonique. Les résultats attendus permettront d’inclure ces organismes, en tant que maillon trophique individualisé, dans les modèles de flux de matière et d’énergie qui transitent par les écosystèmes lacustres.

Ces recherches, pour la plupart exploratoires, ouvrent de nouvelles perspectives en écologie microbienne aquatique, notamment dans le domaine des interactions multipartites (bi-, trisymbioses...) au sein de réseaux microbiens. Elles présentent également des retombée en matière de recherche appliquée, notamment dans les domaines de la maîtrise des cultures en masse de microorganismes d’intérêt économique (aquatcultures, cosmétique, énergie durable...) et de la gestion des écosystèmes et des services associés.

Déroulement de Carrière

  • Depuis 2013 : Directeur de Recherche 1ère Classe (DR1), CNRS
  • 2005-2013 : Directeur de Recherche 2ème Classe (DR2), CNRS
  • 1997-2005 : Chargé de Recherche 1ère Classe (CR1), CNRS
  • 1994-1997 : Chargé de Recherche 2ème Classe (CR2), CNRS
  • 1993-1995 : Assistant de recherche – Université du Québec à Montréal, Canada
  • 1991-1993 : Chercheur Postdoctoral - Centre Océanographique de Rimouski, Canada
  • 1996 : HDR Ecologie Microbienne, Université Blaise Pascal
  • 1991 : Thèse de Doctorat Ecologie Microbienne, Université Blaise Pascal

Responsabilités et Accompagnement de la Recherche

  • Directeur de l’UMR CNRS 6023 LMGE, Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement (environ 100 personnes)
  • Chargé de Mission DIPEE, INEE-CNRS
  • Responsable Equipe ’Virus et Métabolismes Microbiens en Milieu Aquatique’ du LMGE (2010-2014)
  • Animateur de l’Axe ’Microbiologie Environnemental’ du LMGE (2008-2011)
  • Staff Member, The International Ecology Institute
  • Membre Associé du SCOR Working Group 126, Roles of Viruses in Marine Ecosystems
  • Membre nommé de la CSS3 IRD, Commission Scientifique Sectorielle N° 3 (Science des Systèmes Ecologiques) de l’Institut de Recherche pour le Développement
  • Membre nommé du Comité scientifique du Programme National EC2CO (MicrobiEn)
  • Membre nommé du Comité scientifique du Programme Iles Eparses
  • Permanent Associate Editor, Frontiers in Microbiology –Speciality Aquatic Microbial Ecology
  • Guest Associate Editor, Frontiers in Microbiology –Speciality Aquatic Microbial Ecology (2013-2014)
  • Editeur de la nouvelle Fungal Biology Book Series de Springer USA
  • Directeur Scientifique Adjoint de la Revue des Sciences de l’Eau
  • Review Editor, Aquatic Microbial Ecology
  • Associate Editor, Journal of Ecology and Natural Environment
  • Membre Editorial Board, African Journal of Environmental Science and Technology
  • Membre Editorial Advisory Board, The Open Marine Biology Journal
  • Membre Review DataBase, Environmental Microbiology, Limnology & Oceanography
  • Adviser, International Foundation for Science (IFS)
  • Peer Reviewer, European Science Foundation (ESF)

Principaux Projets en Cours, (Consortiums). AAP

Coordinateur : ROME « Rare and Overlooked Microbial Eukaryotes in freshwater lakes » (Responsables Scientifiques : E. Viscogliosi, N. Niquil, U. Christaki ; Associés : C Gachon, J Dolan). ANR Programme Blanc, 2013-2016, 450 000 €

Coordinateur : Action 2 de l’Axe Environnement du CPER  :« Adaptation et réponses des organismes (végétaux, microbiens) et des métabolismes carbonés (CO2, CH4) au changement climatique » Co-Responsable JL Julien, Coordinateur de l’Axe Environnement du CPER C Amblard. Contrat de Projets Etat-Région (CPER), Région Auvergne, 2012-2015, 1 500 000€

Coordinateur : ACHEVIR « Metagenome and diversity of hyperhalophile archaeal viruses (archeoviruses), Lake Retba, Senegal », (Responsables Scientifiques : P Forterre, D Prangishvili, H Ogata, Y Bettarel). Programme FRB, La Fondation pour la recherche sur la biodiversité, 2010-2011, 40 000 €

Bibliographie

Publications Scientifiques (* Auteur Correspondant)

Edition d’ouvrages et volumes spéciaux

- BERTRAND JC, CAUMETTE P, LEBARON P, MATHERON R, NORMAND P, SIME-NGANDO T* (Editors) in press : Environmental Microbiology : fundamentals and applications , Springer, The Netherlands. http://www.springer.com/life+scienc...

-  SIME-NGANDO T* , LAFFERTY KD, BIRON DG (Editors) in press : Roles and mechanisms of parasitism in aquatic microbial communities. Research Topic, Frontier in Microbiology. http://journal.frontiersin.or/Resea...

-  SIME-NGANDO T* & NIQUIL N (Editors) 2011 : Disregarded microbial diversity and ecological potentials in aquatic systems. Springer, The Netherlands, ISBN 978-94-007-1197-6. NB. This item corresponds to the special issue below, formated as a book in the Series Developments in Hydrobiology 216, Series Editor Koens Martens. http://www.springer.com/life+scienc...

-  SIME-NGANDO T* & NIQUIL N (Editors) 2011 : Disregarded microbial diversity and ecological potentials in aquatic systems. Hydrobiologia, Special Issue, Volume 659, N° 1, 115 pages, January 2011. Springer, The Netherlands.

-  SIME-NGANDO T* & LEFEVRE E (Editors) 2010 : Molecular diversity of heterotrophic flagellates in aquatic ecosystems. Editions Universitaires Européennes. UK, 204 pages, Juillet 2010, ISBN 978-613-1-51605-4. https://www.morebooks.de/store/fr/b...

- COLOMBET J & SIME-NGANDO T (Editors) 2010 : Virus et prophages dans les écosystèmes aquatiques. Editions Universitaires Européennes. UK, 204 pages, Avril 2010, ISBN 9786131502743. https://www.morebooks.de/store/fr/b...

- DOLAN J, MOSTAJIR B & SIME-NGANDO T (Editors) 2009 : Rassoulzadegan@Villefranche : 3 Decades of Aquatic Microbial Ecology. Aquatic Microbial Ecology, Special Issue, Volume 57, N° 3, 141 pages, December 2009. Inter-Research Science Center (IR), Oldendorf/Luhe, Germany. http://www.int-res.com/abstracts/am...

Chapitres d’Ouvrages et de Volumes Spéciaux sur Invitation

-  SIME-NGANDO T* (2014). Environmental bacteriophages : viruses of microbes in aquatic ecosystems. In : SIME-NGANDO T*, LAFFERTY KD, BIRON DG (Editors) in press : Roles and mechanisms of parasitism in aquatic microbial communities. Research Topic, Frontier in Microbiology 5 : 355. doi : 10.3389/fmicb.2014.00355.

- MOSTAJIR B, AMBLARD C, BUFFAN-DUBAU E, de WIT R, LENSI R, SIME-NGANDO T (in press). Microbial food webs in aquatic and terrestrial ecosystems. In : BERTRAND JC, CAUMETTE P, LEBARON P, MATHERON R, NORMAND P, SIME-NGANDO T (Editors) in press : Environmental Microbiology : fundamentals and applications , Springer, The Netherlands

- BOUDOURESQUE CF, CAUMETTE P, BERTRAND JC, NORMAND P, SIME-NGANDO T (in press). Systematic and evolution of microorganisms : general concepts. In : BERTRAND JC, CAUMETTE P, LEBARON P, MATHERON R, NORMAND P, SIME-NGANDO T (Editors) in press : Environmental Microbiology : fundamentals and applications , Springer, The Netherlands

-  SIME-NGANDO T* , COLOMBET J (in press) : Roles Of Viruses In Aquatic Ecosystems. In : Encyclopedia of Life Support Systems (EOLSS), UNESCO, Eolss Publishers, Oxford, UK, [http://www.eolss.net]

- GLEASON FH, KARPOV SA, LILJE O, MACARTHUR DJ, VAN OTGEN FF, SIME-NGANDO T (2014) : Zoosporic parasites of phytoplankton. In : JONES GARETH EB, HYDE KD, PANG KL, (Editors) : Freshwater fungi and fungus-like organisms. De Gruyter Series Marine and Freshwater Botany, pp. 279-304.

- RASCONI S, BOUTHEINA G, NIQUIL N, JOBARD M, SIME-NGANDO T (2014) : Parasitic chytrids sustain zooplankton growth during inedible algal bloom. In : SIME-NGANDO T*, LAFFERTY KD, BIRON DG (Editors) in press : Roles and mechanisms of parasitism in aquatic microbial communities. Research Topic, Frontier in Microbiology 5 : 229. doi : 10.3389/fmicb.2014.00229.

- GLEASON FH, LILJE O, MARANO AV, SIME-NGANDO T , SULLIVAN BK, KIRCHMAIR M, NEUHAUSER S (2014) : Ecological functions of zoosporic hyperparasites. In : SIME-NGANDO T*, LAFFERTY KD, BIRON DG (Editors) 2014 : Roles and mechanisms of parasitism in aquatic microbial communities. Research Topic, Frontier in Microbiology 5 : 244, doi : 10.3389/fmicb.2014.00244

- BERTIN P*, SIME-NGANDO T* , Debroas D, Le Paslier D, Marmeisse R, Monchy S, Plewniak F (2013) : Fonctionnement des écosystèmes : métagénomique et intégration des omiques. In : Institut Ecologie et Environnement (INEE) du CNRS, Cahier de Prospective N° 5, Génomique Environnemental, pp. 73-82.

-  SIME-NGANDO T* , RASCONI S, GERPHAGNON M (2013) : Diagnose of parasitic fungi in the plankton : technique for identifying and counting infective chytrids using epifluorescence microscopy. In : GUPTA VK, TUOHY M, MANIMARAN A, TURNER KM, O’DONOVAN A (Editors) : Laboratory protocols in fungal biology : current methods in fungal biology. Springer, New York, pp. 169-174. http://www.springer.com/life+scienc...

-  SIME-NGANDO T* , JOBARD M (2013) : Development of a real-time quantitative PCR assay for the assessment of uncultured zoosporic fungi. In : GUPTA VK, TUOHY M, MANIMARAN A, TURNER KM, O’DONOVAN A (Editors) : Laboratory protocols in fungal biology : current methods in fungal biology. Springer, New York, pp. 421-426. http://www.springer.com/life+scienc...

-  SIME-NGANDO T* , JOBARD M, RASCONI S (2013) : Fluorescence in situ hybridization of uncultured zoosporic fungi. In : GUPTA VK, TUOHY M, MANIMARAN A, TURNER KM, O’DONOVAN A (Editors) : Laboratory protocols in fungal biology : current methods in fungal biology. Springer, New York, pp. 231-233. http://www.springer.com/life+scienc...

-  SIME-NGANDO T* (2013) : Fungal zoospores in aquatic ecosystems. In : McGraw-Hill Yearbook of Science & Technology 2013 and the online edition AccessScience (http://www.accessscience.com). The McGraw-Hill Companies, New York, pages 174-176

-  SIME-NGANDO T* (2012) : Phytoplankton chytridiomycosis : fungal parasites of phytoplankton and their imprints on the food web dynamics. In : GROSSART HP, RIEMANN L, TANG KW (eds) : Molecular and functional ecology of aquatic microbial symbionts. Frontiers Microbiology, 3/361. doi : 10.3389/fmicb.2012.00361.

- COLOMBET J, SIME-NGANDO T* (2012) : Use of PEG, Polyethylene glycol, to characterize the diversity of environmental viruses. In : MENDEZ-VILAS A. (Editor) : “Current microscopy contributions to advances in science and technology, Volume 1, pp 316-322. Formatex Research Center, Badajoz, Spain.

- MOSTAJIR B, AMBLARD C, BUFFAN-DUBAU E, de WIT R, LENSI R, SIME-NGANDO T (2012) : Réseaux trophiques microbiens des milieux aquatiques et terrestres. In : BERTRAND JC, CAUMETTE P, LEBARON P & NORMAND P (eds.) : Ecologie Microbienne : Microbiologie des milieux naturels et anthropisés. Les Presses Universitaires de l’Université de Pau et des Pays de l’Adour, France

-  SIME-NGANDO T* & NIQUIL N (2011) : Editorial, ‘Disregarded’ microbial diversity and ecological potentials in aquatic systems : a new paradigm-shift ahead. In : SIME-NGANDO T, NIQUIL N (Editors) : Disregarded microbial diversity and ecological potentials in aquatic systems. Hydrobiologia, Special Issue, Volume 659, N° 1, p 1-4. Springer, The Netherlands.

-  SIME-NGANDO T* , LEFEVRE E, GLEASON FH (2011) : Hidden diversity among aquatic heterotrophic flagellates : ecological potentials of zoosporic fungi. In : SIME-NGANDO T, NIQUIL N (Editors) : Disregarded microbial diversity and ecological potentials in aquatic systems. Hydrobiologia, Special Issue, Volume 659, N° 1, p 5-22. Springer, The Netherlands.

- NIQUIL N, KAGAMI M, URABE J, CHRISTAKI U, VISCOGLIOSI E, SIME-NGANDO T (2011) : Potential role of fungi in plankton food web functioning and stability : a simulation analysis based on Lake Biwa inverse model. In : SIME-NGANDO T, NIQUIL N (Editors) : Disregarded microbial diversity and ecological potentials in aquatic systems. Hydrobiologia, Special Issue, Volume 659, N° 1, p 65-79. Springer, The Netherlands.

- WOMMACK KE, SIME-NGANDO T , WINGET DM, JAMINDAR S, HELTON RR (2010) : Filtration-based methods for the collection of viral concentrate from large water samples. In : WILHELM SW, WEINBAEUR MG, SUTTLE CA (Editors) : Manual of Aquatic Viral Ecology, Chapter 12, pp 112-117. Advancing the Science for Limnology and Oceanography (ASLO), Inc, Waco, Texas, USA. http://www.aslo.org/books/mave/

- DOLAN JR, MOSTAJIR B, SIME-NGANDO T (2009) : Rassoulzadegan in Villefranche-sur-Mer and the ’evolution’ of marine microbial ecology over the last 3 decades. In : DOLAN J, MOSTAJIR B, SIME-NGANDO T (Editors) : Rassoulzadegan@Villefranche : 3 Decades of Aquatic Microbial Ecology. Aquatic Microbial Ecology, Special Issue, Volume 57, N° 3, p 221-225. Inter-Research Science Center (IR), Oldendorf/Luhe, Germany. http://www.int-res.com/abstracts/am...

- CARRIAS JF & SIME-NGANDO T (2009) : Bactteria attached to surfaces. In : Encyclopedia of inland waters, Volume 3, pp. 182-192, Elsevier, Oxford, UK

- AMBLARD C, BOISSON JC, BOURDIER G, FONTVIEILLE D, GAYTE X & SIME-NGANDO T (1998) : Ecologie microbienne en milieu aquatique : des virus aux protozoaires. In : ERB F & VILLENEUVE JP (Eds.) - "Les sciences de l’eau : bilan et perspectives". Journal of Water Sciences 11 : 145-162

-  SIME-NGANDO T* , GOSSELIN M, JUNIPER K & LEVASSEUR M (1997) : Changes in sea-ice phagotrophic microprotists (20-200 µm) during the spring algal bloom, Canadian Arctic Archipelago. In : THERRIAULT JC, DEVINE L et FUKUCHI M (Eds.) - The Canadian-Japan SARES Project on first-year sea ice. Journal of Marine Systems 11 : 163-172

-  SIME-NGANDO T* , JUNIPER K & DEMERS S (1997) : Ice-brine and planktonic microheterotrophs from Saroma-Ko Lagoon, Hokkaido (Japan) : Quantitative importance and trophodynamics. In : THERRIAULT JC, DEVINE L et FUKUCHI M (Eds.) - The Canadian-Japan SARES Project on first-year sea ice. Journal of Marine Systems 11 : 149-161

- VEZINA AF, DEMERS S, LAURION I, SIME-NGANDO T , JUNIPER SK & DEVINE L (1997) : Carbon flows through the microbial food web of first-year ice in Resolute Passage (Canadian High Arctic). In : THERRIAULT JC, DEVINE L et FUKUCHI M (Eds.) - The Canadian-Japan SARES Project on first-year sea ice. Journal of Marine Systems 11 : 173-189

- AMBLARD C, BOURDIER G, SIME-NGANDO T , RACHIQ S & CARRIAS JF (1994) : Diel and vertical variations of the microbial stocks (bacteria, heterotrophic flagellates, ciliates, phytoplankton) and their relative activities. Dans : J. FEUILLADE (ed.) : Studies on Lake Nantua (France) : a eutrophic lake on the way to rehabilitation. Archic für Hydrobiology 41 : 125-144

Revues Biobliographiques sur Invitation

- MARANO AV, EDWARDS JE, GLEASON FH, BÄRLOCHER F, PIRES-ZOTTARELLI CLA, LILJE O, SCHMIDT SK, RASCONI S, KAGAMI M, BARRERA MD, SIME-NGANDO T , BOUSSIBA S (2012) : Quantitative methods for the analysis of zoosporic fungi. Journal of Microbiological Methods 89 : 22-32

- GLEASON F, KUPPER F, AMON J, PICARD K, GACHON C, MARANO A, SIME-NGANDO T , LILJE O (2011) : Zoosporic true fungi in marine environments, a review. Marine and Freshwater Research 62 : 383-393

- RASCONI S, JOBARD M, SIME-NGANDO T* (2011) : Parasitic fungi of phytoplankton : Ecological roles and implications for microbial food webs. Aquatic Microbial Ecology 62 : 123-137

- GACHON C, SIME-NGANDO T , STRITTMATTER M, CHAMBOUVET A, HOON KIM G (2010) : Algal diseases : Spotlight on a black box. Trends in Plant Science 15 : 633-640

- JOBARD M, RASCONI S, SIME-NGANDO T* (2010) : Diversity and functions of microscopic fungi : a missing component in pelagic food webs. Aquatic Sciences 72 : 255-268

- SIME-NGANDO T* & COLOMBET J (2009) : Virus et prophages dans les écosystèmes aquatiques. Canadian Journal of Microbiology 55 : 95-109

- GLEASON FH, KAGAMI M, LEFEVRE E, SIME-NGANDO T (2008) The ecology of chytrids in aquatic ecosystems : roles in food web dynamics. Fungal Biology Reviews 22 : 17-25

-  SIME-NGANDO T* , BETTAREL Y, CHARTOGNE C & SEAN K (2003) : The imprint of wild viruses on freshwater microbial ecology. Recent Research Development in Microbiology 7 : 481-497

-  SIME-NGANDO T* (1997) : Importance des virus dans la structure et le fonctionnement des réseaux trophiques microbiens aquatiques. Année Biologique 36 : 181-210

Articles scientifiques

In Press, 2014

- JOBARD M, PESSIOT J, NOUAILLE R, SIME-NGANDO T (in press) : Microbial diversity in support of waste dark fermentation. Trends in Biotechnology

- PALESSE S, COLOMBET J, PRADEEP RAM AS, SIME-NGANDO T (2014) : Linking host prokaryotic physiology to viral lifestyle 1 dynamics in a temperate freshwater lake (Lake Pavin, France). Microbial Ecology 68 : 740-750

- CHRISTAKI U, LEFEVRE D, GEORGES C, COLOMBET J, CATALA P, SIME-NGANDO T , BLAIN S, OBERNOSTERER I (2014) : Microbial food web dynamics during spring phytoplankton blooms in the naturally iron-fertilized Kerguelen area (Southern Ocean). Biogeosciences Discussion 11 : 6985-7028

- FOUILLAND E, TOLOSA I, BONNET D, BOUVIER C, BOUVIER T, BOUVY M, GOT P, LE FLOC’H E, MOSTAJIR B, ROQUES C, SEMPERE R, SIME-NGANDO T , VIDUSSI F (2014) : Bacterial carbon dependence on freshly produced phytoplankton exudates under different nutrient availability and grazing pressure conditions in coastal marine waters. FEMS Microbiology Ecology 87 : 757-769

- LONTSI DJIMELI C, TAMSA ARFAO A, NOAH EWOTI OV, EBIANE NOUGANG M, MOUNGANG ML, BRICHEUX G, NOLA M, SIME-NGANDO T (in press) : Mixture of sodium hypochlorite and hydrogen peroxide on adhered Aeromonas hydrophila to solid substrate in water : Impact of concentration and assessment of the synergistic effect. International Journal of Bacteriology, Article ID 121367, 13 pages http://dx.doi.org/10.1155/2014/121367

- PRADEEP RAM AS, PALESSE S, COLOMBET J, THOUVENOT A, SIME-NGANDO T (2014) : The relative importance of viral lysis and nanoflagellate grazing for prokaryote mortality in temperate lakes. Freshwater Biology 59 : 300-311

- CHRISTAKI U, KORMAS KA, GENITSARIS S, GEORGES C, SIME-NGANDO T , VISCOGLIOSI E, MONCHY S (2014) : Winter-summer succession of unicellular eukaryotes in a meso-eutrophic coastal system. Microbial Ecology 67 : 13-23

- FOKAM Z, NANA PA, NGASSAM P, BRICHEUX G, BOUCHARD P, VIGUES B, SIME-NGANDO T (2014) : Morphological description of four new species of Nyctotherus (Ciliophora : Nyctotheridae : Heterotrichida), commensal ciliates of the digestive tract of a terrestrial Oligochaete (Megascolecidae) from the northwest region of Cameroon. Parasitology 8 : 62-70

- LONTSI DJIMELI C, TAMSA ARFAO A, NOAH EWOTI OV, BRICHEUX G, NOLA M, SIME-NGANDO T (2014) : Adhesion of Candida albicans to polythene in Sodium hypochlorite disinfected aquatic microcosm and potential impact of cell surface properties. Current Research in Microbiology and Biotechnology 2 : 479-489

- NANA PA, FOKAM Z, NGASSAM P, AJEAGAH G, MOCHE K, BRICHEUX G, BOUCHARD P, VIGUES B, SIME-NGANDO T (2014) : Influence of ionic contents on the stratification of astomatia and hysterocinetidae (Ciliophora, oligohymenophora) along the digestive tract of Alma Emini (Oligochaete, Glossoscolecidae) from the center region of Cameroon. International Journal of Current Research 6 : 4468-4474.

2013

- PRADEEP RAM AS, PALESSE S, COLOMBET J, SABART M, PERRIERE F, SIME-NGANDO T* (2013) : Variable viral and grazer control of prokaryotic growth efficiency in temperate freshwater lakes (French Massif Central). Microbial Ecology 66 : 906-916.

- GERPHAGNON M, LATOUR D, COLOMBET J, SIME-NGANDO T (2013) : A double staining method using SYTOX-green and Calcofluor White for studying fungal parasites of phytoplankton. Applied and Environmental Microbiology 79 : 3943-3951

- GERPHAGNON M, LATOUR D, COLOMBET J, SIME-NGANDO T (2013) : Fungal Parasitism : Life Cycle, Dynamics and Impact on Cyanobacterial Blooms. Plos One 8, e60894

- TAMSA ARFAO A, NOLA M, LONTSI DJIMELI C, NANDJOU NGUEFACK RV, NOUGANG ME, BRICHEUX G, SIME-NGANDO T (2013) : Comparison of the inhibition of commensally and enteropathogenic E. coli strains in the presence of Eucalyptus microcorys leaves extract in aquatic microcosm. International Journal of Current Microbiology and Applied Sciences 2 : 80-96.

- FOKAM Z, NANA PA, NGASSAM P, BRICHEUX G, BOUCHARD P, VIGUES B, SIME-NGANDO T (2013) : Description of two new species of Sicuophoridae and Nyctotheridae (Heterotrichina), endocommensal in the rectal ampulla of Bufo regularis (Amphibia : Anura) from the Northwest of Cameroon. Protistology 8 : 16-21.

2012

- BORREL G, COLOMBET J, ROBIN A, LEHOURS AC, PRANGHISVILI D, SIME-NGANDO T* (2012) : Unexpected and novel putative viruses in the sediments of a deep-dark permanently anoxic freshwater habitat. The ISME Journal 6, 2119-2127. Cet article a fait l’objet d’un Communiqué de Presse du CNRS : http://www.cnrs.fr/inee/communicati... et de rubriques parues dans Science & Vie (N° 1141, Octobre 2012, Page 24) et Pour la Science (N° 418, Août 2012, Page 13). Il a également été choisi comme une des têtes d’affiches du Volume N° 6 de ISME Journal et offert comme libre d’accès durant le mois de Novembre 2012

- JOBARD M, RASCONI S, SOLINHAC L, CAUCHIE M-H, SIME-NGANDO T*, (2012) : Molecular and morphological diversity of fungi and the associated functions in three European nearby lakes. Environmental Microbiology 14 : 2480-2494

- RASCONI S, NIQUIL N, SIME-NGANDO T* (2012) : Phytoplankton chytridiomycosis : community structure and infectivity of fungal parasites in aquatic systems. Environmental Microbiology 14 : 2151-2170

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Autres publications (Vulgarisation)

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- FONTY G, LEHOURS AC, BORREL G, PETIT-BIDERRE C, PEYRET P, MOREL-DESROSIERS N, MOREL JP, SIME-NGANDO T , AMBLARD C (2011). Le lac Pavin : originalités et intérêts microbiologiques de son compartiment anoxique. Revue des Sciences Naturelles d’Auvergne 75 : 117-136

- 142. JACQUET S, DOMAIZON I, MASQUELIER S, LEPERE C, GUILLOU L, CHAMBOUVET A, DEBROAS D, SIME-NGANDO T (2011). Virus, bactéries et protistes pathogènes : rôle insoupçonné des parasites dans le fonctionnement des écosystèmes aquatiques. Courrier de l’Environnement 60 : 37-50

- LEHOURS AC, CARRIAS JF, AMBLARD C, SIME-NGANDO T , FONTY G (2010) : Les bactéries du lac Pavin. Pour la Science 387 : 30-35.

- PERSONNIC S, DUHAMEL S, BETTAREL Y, SIME-NGANDO T , JACQUET S (2006). Les virus planctoniques : un compartiment clé des écosystèmes aquatiques. Courrier de l’Environnement, 53 : 19-34

- DUHAMEL S, PERSONNIC S, JACQUET S, DOMAIZON I, SIME-NGANDO T , DUMAS B (2005). Importance des virus en milieu lacustre. INRA Mensuel 122 : 8-9

-  SIME-NGANDO T* (2003) : Optimiser la recherche et l’innovation en Europe. Journal de l’Université Blaise Pascal, 16 : 1-4

Rubriques parues dans des magazines scientifiques sur nos recherches

- Les virus peuvent aussi avoir une forme cubique. Science & Vie Octobre 2012, N°1141, Page 24

- Le lac Pavin, monde étrange. Pour la Science Août 2012, N° 418, Page 13

- Champignons : les gardiens du lac. Journal du CNRS Novembre 2011, N° 262, Page 10